Affymetrix公司研制了全球首张基因芯片，发表顶级杂志最好最多，最受国际认可，市场份额最高，是最知名的芯片公司。

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Notch信号靶标基因表达PCR芯片包含了Notch经典信号通路的转录因子和研究验证得到的高关联性靶标基因，通过该芯片得到的结果可用于Notch信号传导激活和抑制研究。

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小鼠全转录本表达谱芯片，约有4个探针来针对每个外显子 / 约有40个探针来针对每个基因，覆盖经验性及预测的外显子序列，约1000000个外显子。可用于基因表达和可变剪切分析。

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该芯片可以检测18,000个犬的mRNA/EST转录子，和超过20,000个非冗余的预测基因。

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Arraystar m6A-mRNA&lncRNA表观转录组芯片，可定量检测mRNA&lncRNA中m6A的表观转录修饰水平。

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利用白血病基因表达PCR芯片研究者即能够利用该芯片简单可靠地同时检测白血病的发生和发展相关的基因表达。

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Human610-quad在一张芯片上可平行进行4个样品的检测，显著的增加了样本输出信息量，减少了实验操作中的误差。Human610-quad广泛的采用了HumanHap550芯片的内容，以及额外增加了60000个遗传标记。Human610

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大鼠全基因组染色质免疫共沉淀芯片,大鼠chip芯片2.1M

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微珠液相芯片，芯片内30次技术重复，准确率高，起始RNA需求量少。

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该芯片包括约4,300 Plasmodium falciparum 的转录子和约14,900 Anopheles gambiae 转录子。

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